學校由原四川大學、原成都科學技術(shù)大學、原華西醫(yī)科大學三所全國重點大學經(jīng)過兩次合并而成。原四川大學起始于1896年四川總督鹿傳霖奉光緒特旨創(chuàng)辦的四川中西學堂,是西南地區(qū)最早的近代高等學校;原成都科學技術(shù)大學是新中國院系調(diào)整時組建的第一批多科型工科院校;原華西醫(yī)科大學源于1910年由西方教會組織在成都創(chuàng)辦的華西協(xié)合大學,是西南地區(qū)最早的西式大學和中國最早培養(yǎng)研究生的大學之一。1994年原四川大學和原成都科學技術(shù)大學合并為四川聯(lián)合大學,1998年恢復“四川大學”校名。2000年與原華西醫(yī)科大學合并組建為新的四川大學。